在女儿入党需要进行政审时，若父亲档案缺失，可通过以下方式处理：

一、档案缺失的应对措施补充证明材料若父亲曾就职，可联系原单位开具工作证明、工资单等材料若为党员或参与过社会组织，可向相关组织申请证明。通过其他途径证明户籍材料：提供户口本等户籍登记证明，体现亲属关系。社保记录：向社保部门申请打印缴费记录作为辅助材料。亲子关系证明：若需确认亲子关系，可提供《出生医学证明》或进行亲子鉴定。重新建立档案若无法补办，可尝试重新建档，需提交身份证明、学历证明等材料，并按档案管理机构要求操作。二、政审的核心关注点父亲档案缺失本身不影响政审：政审重点考察申请人本人的政治表现及家庭背景的合规性，而非档案完整性。需如实说明情况：向党组织主动说明父亲档案缺失原因，并提供现有证明材料，避免因隐瞒引发疑虑。